L'une des phases importantes de la démarche HQE, est celle de la hiérarchisation des " exigences " environnementales.

En effet, tout n'est pas possible en même temps. Le Maître d'ouvrage doit donc établir une liste de priorités en choisissant parmi les quatorze " cibles de la qualité environnementale ", les trois ou quatre qui lui semblent les plus importantes et sur lesquelles un maximum d'effort sera concentré.

La cible n°4 "Gestion de l'énergie" devra en faire partie pour permettre au Maître d'ouvrage de bénéficier des aides de l'ADEME.

De même, dans cette hiérarchisation, quatre ou cinq autres cibles seront retenues pour un traitement approfondi. Les cibles restantes se doivent d'être traitées d'une façon évidemment très correctes, au minimum conformes à la réglementation ou au bonnes pratiques. Ces choix se font en fonction du terrain sur lequel sera installée la construction, de la destination du bâtiment et de toutes les caractéristiques propres au projet.

Bien comprendre cette démarche permet de répondre aux demandes des Maîtres d'ouvrage et Maîtres d'oeuvre de plus en plus impliqués dans l'HQE.